はい。スマホとPCなど、セキュリティを担保できる範囲で利便性のために
複数端末への設定を行ってかまいません。

ただし、複数回登録を行うと、過去の設定が無効化されるため、
以下リンクのページの通り、同じ認証シードで、すべてのアプリに設定を行う必要があります。
https://icts.nagoya-u.ac.jp/ja/services/nuid/CAS/regist-multi.html